本课程包含水处理生物学基础、污染物的生物分解与转化、水质安全与生物监测等三部分内容。微生物部分先讲微生物的基本概念、分类、形态和生理生化特点，然后将其与实际水处理工程进行结合，讨论具体案例；污染物的生物分解、转化部分主要讲述各种污染物生物降解的原理、工艺和运行参数；水质安全部分主要讲述病原菌的危害和检测方法。